Nat Microbiol:与炎症性肠病和癫痫有关的肠型

比利时VIB-KU Leuven生物学之中心讲师Jeroen Raes于2012年创立了Flemish Gut Flora计划，旨在考虑到保健系统性消化系统生物集合的值得注意界限，对3000多名保健数以千计的腐肉样本来进行了测序。不太可能，他们在《Nature Microbiology》撰文，描绘出了缺失某些抗炎酵母菌的B2肠型式在多病症之中的高存活率数据分析。比较生物组病变性肠患（IBD）是以消化系统慢性病变为特征的几种疾患，包括溃疡性大肠和克罗恩患。病症硬化性腹腔炎（PSC）是一种慢性肝患，常有腹腔病变和结疤，也常常有IBD。在取而代之数据分析之中，VIB-KU-Leuven的科学家描绘出了IBD和PSC患征的生物组分。Jeroen Raes讲师却说：“多年来，为数众多的许多数据分析小组都试图描绘出与疾患系统性的生物集合转变。尤其是IBD格外是生物学数据分析的热点。我们的数据分析在三个全面性不同于先前。首先，我们比较了来自Flemish Gut Flora计划目录之中少于3000名保健数以千计的生物集合。第二，在我们的比对之中，我们不仅捕捉到了腐肉样本之中不同酵母菌的百分比，还使用了一种取而代之技术来假设它们的丰度。第三，我们修正了我们的数据分析结果之中的一些因素，如强而有力的腐肉等等这些因素在所数据分析的疾患之中都很常见，但实际上它们亦会冲击生物组比对的结果。”疾患的生物指纹相辅相成科学家在表征生物集合比对全面性的独特专业知识和他们对保健系统性生物集合变异的知识，科学家们辨认出了一种变异的生物集合结构设计——也被被称作肠型式——在患征集合之中具有很高的存活率。虽然13%的保健数以千计之中也捕捉到到了这种肠型式，但PSC和IBD患征的存活率格外高，在38%到78%间。策划这项数据分析胃肠患学家Séverine Vermeire讲师解释却说：“这种我们称之为B2肠型式的异常生物集合结构设计具有偏高酵母菌丰度和生物多样性的优点。它的抗炎酵母菌，如粪酵母，相对来却说不足。事实上，我们辨认出B2型式肠炎患征的消化系统病变水平很高。即使在保健人之中，这种消化系统型式式的据称的大体上都是病变水平也稍高。”消化系统病变、生物和抑郁症有点吃惊的是，就在几个月前，Raes讲师的实验室描绘出了一种十分相似的生物集合转变，这种转变与较偏高的生活质量甚至抑郁有关。Jeroen Raes讲师却说：“在不同的患征集合体之中捕捉到到的生物集合落转变显然有很大的重叠。我们在大约26%的抑郁症患征之中检测到了B2型式肠型式。虽然消化系统生物集合已被显然在溃疡性大肠和克罗恩患等疾患的发展之中发挥作用，但对于抑郁症来却说，这一点还不太清楚。然而，我们将在未来的数据分析之中格外具体地探讨B2肠型式和抑郁症间的人关系。”虽然大约13%的保健人也是B2肠型式的据称，但数据分析职员阐释这不太可能盲目关心。Jeroen Raes讲师：“在这一点上，我们不能根据一个人的消化系统型式式对疾患易感性或风险做出任何预测。此外，消化系统型式式不是单独的，可以通过偏离乳制品来偏离。所捕捉到到的疾患与生物集合间的联系相当反之亦然消化系统酵母菌可能造成了了疾患。许多个人、生活方法和因素与B2肠型式有关。然而，由于在某些个体之中，病变也是B2的系统性因素，我们认同亦会进一步数据分析潜在的因果人关系。”许多现代出处：Vieira-Silva S1,2, Sabino J3, Valles-Colomer M1, et al. Quantitative microbiome profiling disentangles inflammation- and bile duct obstruction-associated microbiota alterations across PSC/IBD diagnoses. Nat Microbiol. 2019 Jun 17.