Cell Res：北京基因组所合作伙伴揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合氨基酸和单氨基酸 DNA 都是由的比如说核酸结构设计，在原核和真核人类的基因组里地理分布广泛且或多或少。R-loop 在很多关键的人类学过程里造就重要种系统，包括细胞核词句、激活诱导、DNA 损伤整修以及基因组准确度等，但其如何被精确诱导的系统尚能不清楚。m6A 词句作为据称 RNA 上原子量最高的词句类别，广泛参与哺乳动物的成年期、抗病毒、干细胞更新、脂肪分化、以及生成和重新分配等生命过程。然而，目前尚能不清楚 m6A 是否能作为 R -loop 里 RNA 反应物的所谓不同之处来诱导 R -loop 素质，进而造就各种人类学种系统。里科院北京基因组研究工作所杨运桂、任捷与上海交通大学生科院孙前文制作组合作研究工作，注意到 m6A 能稳定 R-loop 的转变成，进而诱导基因激活的适当取消。这一科研成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线发表于《细胞研究工作》（Cell Research）杂志。研究工作制作组首先通过斑点化学键杂交和抗病毒荧光系统设计，注意到敲低 m6A 及第基重新分配酶 METTL3 显着降低 R -loop 素质，且该诱导关键作用缺少 METTL3 及第基重新分配酶活性。随后，制作组的组织利用高效小化学键色谱联合质谱系统设计，注意到相较于基因紧密结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 反应物有更加富集的 m6A 词句。进一步利用基于单氨基酸 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合氨基酸抗病毒共沉淀高通量核酸系统设计（ssDRIP-seq），注意到缩水的 R -loop 主要富集在激活取消区外，R-loop 改变以往与 m6A 的间距和词句素质特别。为了探索 m6A 对 R -loop 诱导的人类学种系统，研究工作制作组手绘了 RNA RNA激活启动子的实时研究工作科研成果，并在 MYC、ACTIN 基因上进行多种激活活性测定，注意到 m6A 有利于 R -loop 转变成是激活取消阶段的关键步骤，可以防止 RNA RNA的激活通读。之后，制作组的组织实现了针对激活通读的报告基因种系统，通过 m6A 词句启动子的突变进一步属实 m6A 对于 R -loop 转变成及激活取消的关键关键作用。该研究工作注意到了 m6A 及第基化词句的共激活诱导种系统，洞察了 RNA 及第基化词句对细胞核结构设计的因素，以及 R-loop 结构设计里的 RNA 反应物被词句后对其自身一个系统的诱导系统，阐释了 m6A 通过稳定 R-loop 而有利于激活正常取消的情形，为进一步研究工作 m6A 与 R-loop 的诱导系统和相应人类学种系统提供了基本的系统设计和假说支撑。该研究工作得到了里国科学院战略性作准备科技专项、东欧国家自然科学以及东欧国家重点研发计划等慈善机构资助。原始出处：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).